RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00619

RNA: RFA_00619
Rfam family: -

			UGACAAUCUUUAUGCUCAUUCUUCCUUCUGAUAGGAGGGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUUCCACAACCCUGAGUAUUGUUGCAUACUGUGCAAUGUAAAUAUUCUUGGUACUCUCAUUUAGAUUGUCAAAUUUAGAGCAUGUUCCAUCAUUUCAAUAUUAUUCAUGAUGGAAUGAUAAUGCUCUAAAUGUUAUUUUUAAUAUAUUAUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.....(((((..........(((...(((......))).))).....................................((((((((.......)))))))).......))))).......((((((((.....(((.(((((........((((.....................))))....))))).))))))...)))))..........
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((....(((.((((......))))((((..........)))).)))............(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..)))))))))...(((((((((((((((((((.............))))))))))....)))))))))((((((....)))))).......
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((..(........(((((((((....))))))))).................................((((((((((((((...))))))))...))))))............)..))))))))..................................................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((..(((......(((((((((....))))))))).................................((((((.........(.(....((....))....).))))))).)))..))))))))..(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....))))))))).............((.......))....(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((..(((((((......)))))))))).))))........((((...))))....(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..)))..........))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((..(((((((......)))))))))).)))).......................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..)))..........))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((((((...((((((......)))))).))).............(((.....)))....(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).((......))..........
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((((..(((((((((....)))))))))................................)))))))((((((((...))))))))........................))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
Multilign(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...........(((((((((....))))))))).................................(((((((((((((.....))))))............)))))))......))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((((((...((((((......)))))).))).............((((...))))....(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((...(((...))).))))))))))....)))))))))))((((....)))).........
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((((..(((((((((....))))))))).............((((...))))........)))))))((((((((...))))))))........................))))))))).(((((((((((((((((((((.............)))))))))))....)))))))))).....................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..)))))))).((((((((((((((((((((((.............))))))))))....)))))))))..)))..................
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((....((((((((......))))((((..........))))))))............(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((..(((((((......)))))))))))(.((((.((.((((((...))))..((((..(......))))).....)).).).))))))))).................)))))))))..((((((((((((((((((((.............))))))))..))..))))))))))(........)((((...)))).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......((((((((......))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((......(((((((((....)))))))))............................(((..((((((((((((((...)))))))...)))))))..))).....)))..))))))))).(((((((((((((((((((((.............))))))))))....))))))))))).....................
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((..........(((.(((......))).((((..........))))))).((((.....((((.........)))).(((.....))).(((....)))...))))..........)))))))).....((((((((.(((((((((.............))))))))).....)))))))).((((((....)))))).......
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((.....((((......))))[[.))).)))).....]].(((.....)))........((((....((((((.....)))))).....(((.....)))..))))...)))))))))....((((((((.(((((((((.............))))))))).....)))))))).((((((....)))))).......

---