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UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................................................................................. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((((((((........((((........)))).((((.((......)).))))............((((..(((((((((((......))))))).))))..)).)).....)))))))))))..(((((((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))))))).(((((.....))))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((..(((((((((....)))))..)))).(((((............................))))).))))).........((((((...))))))....))))))))))..((((((((((......(((((((................))))))).........))))))))))................ |
|
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................................................................................. |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((..........(((..................)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((.(((....(((.(((((.............................................))))).)))))).))))......... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((..........(((..................)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((.(((....(((.(((((.............................................))))).)))))).))))......... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((..((((.......((((.((((.....))))..))))............................((..(((((((((((......)))))))).)))..))........))))..))))))((((..(((.(((((.(((((((................))))))).....))))))))..))))................ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((((((........((((........)))).((((............))))...........(((((..(((((((((((.(...)))))))).))))..)).)))....))))))))))))((((((((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))))))))(((((.....))))). |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((((((.......((((.((((.....))))..))))...................................((((((((......))))))))................))))))))))..(((((((((.(((((.(((((((................))))))).....))))))))))))))................ |
|
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((((((.......((((................)))).....................................((((..........))))..................))))))))))....((((((((......((((((..................)))))).........)))))))).................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((..........(((..................)))....................................(((((((......)))))))........))))).....((((.(((....(((.(((((.............................................))))).)))))).))))......... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((..((((.......((((.((((.....))))..))))............................((..(((((((((((......))))))).))))..))........))))..))))).((((..((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))..))))................ |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((((((((.((((...((((........))))..))))..........................(((((..(((((((((((......))))))).))))..)).)))....)))))))))))).(((..((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))..)))................. |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.((((..((((.(((....((((........))))..(((.((......)).))))))............((..(((((((((((......)))))))).)))..))........))))..))))))((((..(((.(((((.(((((((................))))))).....))))))))..))))................ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(......................................................................................................................(..................)........................)...........((..))....................... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((..((((...........................................................((..(((((((((((......)))))))).)))..))........))))..))))).((((..((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))..))))................ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((..((((.......((((.((((.....))))..))))............................((..(((((((((((......)))))))).)))..))........))))..))))).((((..((((.((((.(((((((................))))))).....))))))))..))))................ |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((((......((((........)))).((((............))))...........))))..((((...(((((......))))).((((.....))))..)))).((((((..((....))..))))))..(((((((................)))))))...(((((((..((....)).)))))))....... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((......((((........)))).{{{{....)))))...}}}}...(((..((((.....))))...(((((......))))).((((.....)))).......((((((..((....))..))))))..(((((((.............[[[))))))).............]]].))).(((.....)))... |
