RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00695

RNA: RFA_00695
Rfam family: Hammerhead_1

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((.......((((..............................................................................))))...((((.)))).)))).))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....)))).))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...(((...((((..(((((((((.......(((((((..((((........)))))))))))..))).).)).)))...))))..))).....))))....)))).))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................................................................
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((....(((...((((((....))))...(.((.(((((((..................)))))))..)).).............))..)))......)))...........
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.(...(((.(((....(((((..((.(.((.(((((((..................)))))))..)).)...))..))))))))...)))...)))))....)))).))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((....))..))))((.((................(((((((..................)))))))..((((((..........................)))))))).)).
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Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........(((((.....(((((....))))).......(((((((..................)))))))..[[[[[[.....)))))................]]]]]]......
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(................................................................................................)......)))).))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................(((((....)))))..(((..(((((((..((((........)))))))))))..[[[[[[...............)))........]]]]]]......
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....))))...
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((....(((..(((.....((((..((...((.(((((((..................)))))))..)).....))..)))).))).)))......))))....)))).).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((......((...................................................................))...................))..................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((..((((.(((((((((....))))).......(((((((..................)))))))..[[[[[[...))))))))...............]]]]]]...)))
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((...((.(.((..................................................................................))....)......)).)))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....))))...
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((..........(((((....))))).......(((((((..((((........)))))))))))..(((((...............)))))....))))....))))...
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((((........).)))((((((....))))))..(((.(((((((..((((........)))))))))))))).)(((.(((..((((((((......)))).))))..)))).))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(.......(...................................................................................................)...).))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((...(((...(((.....((((..((.(.((.(((((((..................)))))))..))...).))..)))).)))..))).....))))....))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((...(((...((((....((((..((.((((.(((((((..((((........)))))))))))..))..)).))..))))))))..))).....))))....))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((......((((....)))).(((..((((......)))).(((.....))).((((......))))....))).)))).....((((.........)))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((....(((((.....(((((....))))).......(((((((..................)))))))..[[[[[......)))))....]]]]]............)))....

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