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GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))....((((((....)))))))).) |
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CMfinder(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((.((((((....))))))))..)).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................................................................((((...)))) |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................................................................((((...)))) |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..........))).((.((....))..))..((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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|
DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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....((((.((((((....))))))..))))...((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((.((((((....))))))))..)).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
|
Murlet(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Murlet(20)
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
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|
PPfold(20)
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((((....(((((((((....)))))....)))).))))))..((((((((....)))))))).. |
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RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((((........(((((....))))).........))))))..((((((((....)))))))).. |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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((..((.((((((....))))))))..)).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
|
RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
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RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
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[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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....((.((((((....)))))))).........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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TurboFold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..((.((((((....))))))))..)).....((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....)))))))).. |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))..((((.....))))....((((....(((....))).(((.....))).))))..((((((((....)))))))).. |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((....))))))..((((.....))))....((((....(((....))).(((.....))).))))..((((((((....)))))))).. |
