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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RFA_00817



RNA: RFA_00817
Rfam family: R2_retro_el

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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((((...............))))))......((((...........(((.........(((((....(((((((((((......)))))......))))))...)))))(((((((..................)))))))..................))).))))..
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((...........(((((((((((.........)))..........))))))))....................)))))).....)))))))).........(((((......)))))..................((((((...........)))))).......................................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...............................((((((...............))))))...............................))))))(....(((((((((((......)))))......))))))...).....((((((.....(((.....)))..)))))).............................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((((...............)))))....).(((((.......((((((............(((....(((((((((((......)))))......))))))...)))((((((...........))))))..........))))))((((.....))))....))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.((........(((((((((((.........)))..........))))))))........))..........)))))).....))))))))...(((((((((((......))))))..(((.......)))..((((((..(.....)..))))))................((((.....))))..)))))...
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((((...............)))))).....(((((............((.........(((((....((((((.((((......)))).......))))))...))))).((((((..(((.(.......))))))))))...................))..))))).
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..............(((((((((((.........))))..........)))))))..........................))..)))))))))...(((((.(((((.[[[[[)))))........]]]]]......((({{{{{.....{{{..)))}}}..}}}}}......................)))))...
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((.((((.....(((((((((((.........))))..........)))))))...(((......))).....)))).)))..)))))))))...(((((.(((((......)))))...((((((((..(((..((((((..(.....)..)))))))))))).)))))....((((.....))))..)))))...
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((................(((((((.(((.........)))...........)))))))...(((......)))...............)))))))))...(((((.(((((......)))))...(((((...........(((((...........)))))........)))))....((((.....))))..)))))...
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................................(.((((((...............)))))))....(((((...........((((.((......((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))...(((((.....(((.....)))..))))).(((.....)))...))..)))).))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((.(((((....(((((((((((.........))))..........)))))))...(((......)))....))))).)))..)))))))))...(((((.(((((......)))))...((((((((..(((..((((((..(.....)..)))))))))))).)))))....((((.....))))..)))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((..................((((.........))))....((((....)))).(((........)))......))))))....(((.....))).(((((.(((((......)))))..((((.......))))..(((((...........))))).((((....))))....((((.....))))..)))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((............................((((...{{{{{{))))...........}}}}}}...))).(((....((((......))))...((((........)))).(((((..[[[[)))))...(((..]]]].)))...(((((...........))))).((((....))))....((((.....))))....)))...