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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00009



RNA: SPR_00009
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((...((.((((..(.((((((...))).(((((...)))))))).)..))))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)))......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((............................................................))))))....
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ................((((((.((((..........(((((.....)))))(.......).)))).))))))...
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((...)))).(.((((((.((((..........((((((...))))))(.......).)))).)))))).).
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((...[[[..)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).]]]
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((...[[[[.)))....]]]].(((((.......))))).((((.[[[....))))...]]]..........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))..))))))....
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MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))..(((((.....)))))......(((((.......))))))))))...)).
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PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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