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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00020



RNA: SPR_00020
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...............(((((((((...)))))).)))..((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(..............(((((((...)))))))...).((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))....(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((.............((((((((...))))))).).))((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......(((....))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..[[[[[[.)))....]]]]]]....(((...[[[[)))...]]]]....))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......)))...(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............((((.[[[[[)))).]]]]].....(((((.......))))))))))))....
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
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PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))..(((((((((...)))))).))).(((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((......(((((((((...)))))).))).(((((.......))))).))).......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((................((((((((.....))))).))).(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...(((((....)))))...))))....(((((.......))))))))))))....
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