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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00022



RNA: SPR_00022
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.......((((....)))).)))......((((..((((....))))...))))..)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((...((((....))))..)).)))..((((..((((....))))...)))).))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...................(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....(((.......))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....[[[[............(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((.....))).......((((((..[[[[))).)))...]]]]............))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((...((((....))))..)).)))..((((..((((....))))...)))).))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((...((((....))))..)).)))..((((..((((....))))...))))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......(...........).((((((......))).)))....((((.......)))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...[[[[............(((((.......)))))......((((.......))))))))))))]]]]
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.........)))..(((((.......))))).((((....))))....)))..)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...(((.......)))...))))......((((..((((....))))...))))...))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((.(((.((...(((((..(...)))))).)).))))))).)).).)))..)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...........................................................)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((...((((....))))..)).)))..((((..((((....))))...))))..)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.....)))..(((..(((((.......))))).((((....)))).....))).)))))))....