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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00029
RNA: SPR_00029
Rfam family:
tRNA
| AAGAAACUAGUUAAACUAAUAACACUGGAUUGUCAGACCGGAGUAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).((((.........))))....(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((...)))).....((((..((((...(((((.....)))))..)))).))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((.(((((...(((((.....)))))..))))))))))))........ |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((....(..........)(((((.(((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.................((((.........))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((.(((((...(((((.....)))))..))))))))))))........ |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....((((((((.......[[[[[[[[...............))))))))......]]]]]]]]........ |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......((((...))))..(((((((.(((((...(((((.....)))))..))))))))))))........ |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((................(((((((.(((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))..... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((...)))))).(((((.(((((((.((((((.(..)))))))))))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((...((((...))))..(((((((.(((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))..... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).((((....))))(((((.....)))))..((.....))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((...((((...))))..(((((((.(((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))).... |
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| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))....((((((...(((((.....)))))..))))))...))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))(((.((((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((....)))))((((.(((((.(..(((((..))).))..))))))))))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((...))))...((((((.(((((...(((((.....)))))..)))))))))))))))).... |
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