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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00030
RNA: SPR_00030
Rfam family:
-
| AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA | |||
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| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))..) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.((...............)).)))))).....((((((...))))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.((...............)).)))))))....((((((...)))))).)))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((.......)))).....((((((...))))))........... |
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| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).((((...(((...............)))...)))).))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................(((((.......)))))((((((((((...)))))).))))...... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......(((((((.....................)))))))....(((((.....)))))........... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............(((((((((((((...)))))).)))))))... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....((((((...))))))........... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........((....(((.......(((((.......))))).....[[.)))...))]]............ |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..))).))))))))))))))(((((((((...))))))))))))))... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))..((((.......))))..((.((((((...))))))..))....... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.....................)))))))....((((((...)))))).)))))).... |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.((.((..{{.)).[[))}}.)))))))....((((((...)))))).))))))]].. |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....)))))........... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((.[.[[.)))).(((...]]].....)))((((((((((...)))))).))))...... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................(((((.......))))).............................. |
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| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((...((............))..)))))))....(((((.....))))).)))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((....(((.(((..((((((.(...).))))).)..))).)))...)))..))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......((((((.....................)))))).....((((((...))))))........... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......))))...............((((((((((((.....))))).)))))))... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....)))))..))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....)))))..))))).... |