 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00032
RNA: SPR_00032
Rfam family:
tRNA
| AGAGAUAUUAGUAAAAUAAUUACAUAACCUUGUCAAGGUUAAGUUAUAGACUUAAAUCUAUAUAUCUUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((......)))))))))))).... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((((.....))))..((((((...))))))....((((((......))))))))))))...) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).(((((((...)))))))....(((((......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...(((.......))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((((..........((.(((((((...))))))).)).....(......)))).))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((................(((((((...)))))))....(((((......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((................(((((.......)))))....(((((......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((.............((.((((((((.)))))))).)).(((((......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).((((((.....))))))....(((((......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))....(((((......))))).)))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((................((((((.....))))))....(((((......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((..)))))..((((((((((...))))))))))((((((((..)))))))))))))))... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))....(((((......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.................(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).(((((.(...).)))))....(((((......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).(((((.(...).)))))....(((((......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....)))).((((((.....))))))....(((((......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................(((((((...)))))))...((((((......)))))).......... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))...((((((......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.(....(((((...)))))...).))))....((.(((((((((((......)))))).).)))))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.................(((((((...)))))))....(((((......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).(((((((...)))))))...((((((......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))....(((((......))))).)))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...((((.....)))).((((((.....))))))....(((((......))))).)))))).... |