 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00033
RNA: SPR_00033
Rfam family:
tRNA
| AAGAUAUUAGUAAAAUUCAUUACAUAACUUUGUCAUAGUUAAAUUAUAGGUUUAACUCCUAUAUAUCUUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((.......))))....((((((.......)))))).......... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..............(((......)))............(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((...(((........))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))..... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....................(((......)))...(((((((([[[[[)))))))).]]]]].......... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..................((((.......))))(((..[[[[[)))....]]]]]))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((..((((((((..)))))))))))))))))((((((...)..)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.............................(((((((((...))))))))).....))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................(((((.......)))))...((((((.......)))))).......... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(.(((..)))(((......)))...(((((((((...))))))))))))).))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......))))..((((.......)))).....(((((.......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((...........(((......)))...((((((((.....)))))))).))).))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).)))))).... |