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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00060



RNA: SPR_00060
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..((((((((...))))).......)))..)))))((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((((((...)))))))...)))........(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....................(((((((.....)))))))((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..................(((((.......))))).....((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))((((.....))))(((((.....)))))))((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))........((((((([[[[.))))))).]]]]...........)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((....)))))(((.(((((((((((.[[[[))))).)))))).....))).....]]]].....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....))))..........((((((.....))))))(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))........(((((((.....)))))))((((.......)))).)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((......)).........(([[[[[[...))]]]]]].((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((..((((((..))))))))))))))))))(((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....)))).........(((((((.....)))))))((((.......)))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((...)))))......(((((((.....)))))))((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))((....)).((((((.....))))))(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((....(((((....)))))))).....(((((((.[[[[)))))))((((.......))))...]]]].....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))).........(((((((.....)))))))((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....((((((((.....)))))...))))))......(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((...)))))...(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))).(((.(((((((((((.....))))).)))))).....)))..))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))).(((.(((((((((((.....))))).)))))).....)))..))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))).........(((((((.....)))))))((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((((...))))((..(((((.......)))))..))((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........................................((((.......)))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))........(((((((.....)))))))((((.......)))).)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....))))......(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....))))......(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....