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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00078



RNA: SPR_00078
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((....((((........)))).(((((.......)))))....(..)..)))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((........(((((((......(((((((...))))))).)))))))..)))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((((..((((((.......))))))...))....))))....)))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((........................(((.......))).............))).....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((........(((((.........(((((.....)))))....)))))..)))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((........(((((....)))))(((((.....)))))...........)))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....................(((((((...)))))))..........)))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......(((((((....)))))))...(((....(((....))).))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...((((.(((((....)))))))))....)).))).((...............)).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((.(((((((....)))))))..))))....(((....)))....)))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......................((((.......))))...........)))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))(((((((((..)))).)))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((.......((((((....))))))((((.....))))............)))).....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......((((((((..))))))))........................)))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((........(((((((......((((((.....)))))).)))))))..)))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((.(((((((....)))))))..))))....(((....)))....)))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.......((((((....)))))).........................)))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................((((.....)))).....................
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....((((.....))))...(((((((...)))))))..........)))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((.(((((((....)))))))..))))....(((....)))....)))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((.(((((((....)))))))..))))....(((....)))....)))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....(((((((((....)))))((((((...))))))...))))....)))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((((((...)))))))...((((((..........)))).)).))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((........(((((....)))))..........................)))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((.((((....)))).((((((...))))))...))))....)))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((.((((....)))).(((((.....)))))...))))....)))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((...[[[[.)))).]]]](((((.....)))))...........)))))....