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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00080
RNA: SPR_00080
Rfam family:
tRNA
| GUUGAUGUAGCUUAACCCAAAGCAAGGCACUGAAAAUGCCUAGAUGAGUCUCCCAACUCCAUAAACACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((.(((.((((......)))).(((((.......)))))..((((((......))).)))..))).)) |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))........... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......))))..((((.......)))).....((((......))))))).))).... |
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| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))........... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.(....))))))....((((......))))))).))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....(((........)))........... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((......))))))((((.((..))))))((((((((...))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.....((((......)))).(((((.......)))))............))))............. |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))........... |
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| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.(....))))))....((((......))))))).))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((.(((.(((........))).(((((((...)))))))(...(((........)))....)))).)) |
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| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.(((..((((......)))).(((((.......)))))....((((......))))))).))).... |
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