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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00111



RNA: SPR_00111
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...(((.((...)).)))....)))))).....(((((.......))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((....)))......(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((..[[[..)))))(((((...]]].)))))....(((((.......))))))))))))....
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((....))).(((..[[[[[.)))...]]]]]....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......))))).((((.......))))......((((.......)))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...(((.(.....).)))....)))))).....(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))))(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))).....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((....(((.........))).....))).......(((((.......))))))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....