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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00113



RNA: SPR_00113
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((...(((........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..............(((((.....)))))))))))((((.......)))).)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((..((((........((((((.....))))))......))))..)))).....)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.........)))))((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((........)))..((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.........)))))((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((..[[[[[[)))..]]]]]]....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((........)))..((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((.(.(((((((...)))))))))))))))))))))))....))))))))....
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..((..((((........))))....((.............))..((((.......)).)...))...))).
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((........)))..((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.........)))))((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((...)).)))))((((((.....))))))....((((((....).))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((...........)))))....(.((((..)).)))(.((((((....).))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.........)))).((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.........)))).((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....