 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00117
RNA: SPR_00117
Rfam family:
tRNA
| GCGGGAAUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGGGUCGCGAGUUCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CMfinder(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))...... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..[[[[..)))).((((((((]]]]...))))))))((((.......)))).))))))).... |
| DAFS(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((..))))))))(((((((...)))))))(((((((((..))))))))).)))))))).... |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((((...))))))......(((((.......)))))))))))).... |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).))))))).... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))...))). |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))(((((....).)))).))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((.......))))))))((((.......)))).))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((((....).))))))))((((.......)))).))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((((((....).)))))))(((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).((((((((((..))).)))))))(((((...)..)))).))))))).... |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.(((((..((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))....). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((((((....).))))))).((((.......)))).))))))).... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))).)))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((...[[[[[)))).((((((]]]]])))))).....(((((.......))))).)))))).... |