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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00121



RNA: SPR_00121
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).((((((...)))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(..........)((((((((((...)))))).))))(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.................(((((((.......))))).))..((((.......)))).)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((........))((((((((((...)))))).))))(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).((((((...)))))).....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).(((((.....))))).....(((((.......))))))))))))....
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((.(((....))))((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).((((((...))))))......((((.......)))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((..........))))(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((((...))))))).....((((......))))..)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(.(((((...((((((((((((...)))))).)))).))....)))))).))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).((((((...)))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).(((((.....)))))......((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........))))).(((((.....)))))......((((.......)))).)))))))....