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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00124
RNA: SPR_00124
Rfam family:
tRNA
| AUUCUUUUAGUAUUAACUAGUACAGCUGACUUCCAAUCAGCUAGUUUCGGUCUAGUCCGAAAAAGAAUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((......((((((.....((((.......))))))))))((((......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((...(((((((...((((((((.......)))))).))...))).))))....)))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..((......)).....((((((.......))))))..((((((......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......))))((((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((....))))...(((((((.......)))))).)((((((.(()).)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......(((((....)))))...((((((.......))))))..((((((......)))))).......... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((...[[[[[)))((((((.......)))))).........]]]]]....)))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((....))))..((((((((.......)))))).)).((((......))))..)))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((................((((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((((..))))))(((((((((...)..))))))))((((((..)))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((....))))....((((((.......))))))...(((((......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((((..))))))((((((.......))))))..((((((......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.(...).)))))....(((((......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((....))))..((((((((.......)))))).))(((((......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((....))))....((((((.......))))))...((((((...).)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................((((((.......))))))..((((((......)))))).......... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........(((((.........((((((.......))))))..((((((......))))))...))))).. |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))))))))))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.................((((.......)))((((((....).)))))...))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.................((((((.......))))))...(((((......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))).))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((....))))).(((((.......))))).....((((......)))).))))))).... |