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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00126
RNA: SPR_00126
Rfam family:
-
| GCUGUGUUAGUAUAAAGUAAUAUAUGUGAUUUCUAAUCAUGGGAUCCUUUAGGGACGUAGUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((......)))).(((((.......)))))...((((..))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((......)))))((((((...)))))).....(((...)))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((........((((((...))))))......)))))..)))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............((((........(((((.....)))))......))))............... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ................................................................. |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((......(((((........((((.......))))......)))))....)))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......((((((.....)))))).....)))))..)))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((((........)))))))...((((((.......))))))................... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......(((((((...))))))).....)))))..)))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......(((((((...))))))).....)))))..)))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((..........(((..(.......)..))))))))..)))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((........(((((.....)))))......)))))..)))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((...)))).((((((((((((((.((((..))))))))))))))))))(((((...))))). |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..........)))))..((((((...))))))..................))..... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((..........((((((.......)))))))))))..)))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((((...[[[[[)))))))...((((((.......))))))]]]]]((.........)). |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......((((((.....)))))).....)))))..)))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((...[[[[[))))))..((((((...))))))......]]]]].......))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.(((........))).......)))).)))))....................... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......(((((((...))))))).....)))))..)))))))).... |
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| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......(((((((...))))))).....)))))..)))))))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((((.((((((..))))))...((..))))).))((((...((......).)....)))) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((....(((((.......((((((.....)))))).....)))))..)))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..(((....(((((..........(((..(.......)..))))))))..)))..))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((......)))))..((((((.......)))))).......)))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((((........))))))).(((((.....)))))....(((.....))).......... |