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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00127
RNA: SPR_00127
Rfam family:
-
| AAGGGUGAUUAGGAAUGUUAGAAAGUUGCUAUUUUUUUGAUAUUGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((....(.(..).)..(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (..(((.......((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....))).))))..)))) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((.....((((((((((((.......))))))))))))((((((((...)))).))))))))). |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((.....((((((((((((.......))))))))))))((((((((...)))).))))))))). |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...............((((.((.............)).))))..(((.......)))..(((....))). |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................(((.......)))..(((....))). |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..........(((((((((.......))))))))).(((((.......))))).)))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..............(((((((((((.......)))))))))))((((.......)))).(((....))). |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............((((((((((((.......))))))))))))....((((...))))(((....))). |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((.....((((((((((((.......))))))))))))((((((((...)))).))))))))). |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((......(((((((((((.......))))))))))).((((((((...)))).))))))))). |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((.......((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....))).))))..))). |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((............(((...................)))...(((.......)))..[[[))).]]]. |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((..))))))))))))).(((((((((((..)).))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((.......(((((((((((.......))))))))))).((((((((...)))).)))).)))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......((((((((((((.......))))))))))))...(((((...))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((...[[[[[[[[[[)))))))....]]]]]]]]]]....(((.....)))(((....))). |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((...[[[[[[[[[[)))))))....]]]]]]]]]](((.......)))..(((....))). |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((.....(((((((((((((....).))))))))))))((((((((...)))).))))))))). |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............(((((((((((.........))))))))))).......................... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......((((((((((((.......))))))))))))...(((((...))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((.......((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....))).))))..))). |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((.......((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....))).))))..))). |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((..(.....((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....)))).))))..)). |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((...(........)..))(((((.......)))))(..)....((((((........))))))...... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((.(.....((((((((((((.......))))))))))))(((.((((...))))..)))).))). |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((..(.....((((((((((((.......))))))))))))(((((((.....))).)))))..)). |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((.((((.....))))........((((.....))))..(((((((.....))).)))).)))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((.((((.....))))........((((.....))))..(((((((.....))).)))).)))). |