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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00163



RNA: SPR_00163
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((.((...((((.((((((...........))))))..))))....)).)))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((.........)))).....((((.......)))).)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.........)))..(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............(((..((((.........))))......[[[)))....]]]..)))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))..))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((....)).)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.........)))))...........................(((((.......)))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...........((((((((...))))))))...........(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((..))))))(((......)))...((((....(..........)...)))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...........((((((((...))))))))...........(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.[[[[[...)))).((((((.....)))))).....((((.]]]]].))))..))))))....