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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00166



RNA: SPR_00166
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((.......))).(((((.......))))).....((((........)))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((...((((....)))).)).)))))......................)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((.((....(((....)))..)).))))))...((((((........)))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((......((((....))))....)))))....((((((........)))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..(((((......((((....))))....)))))......((............))..)))).....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.......))).((((((.....)))))).....((((........)))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.((((((......((((....))))....))))))...((((((........)))))))))......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((.......))).((((((.....))))))...((((((........)))))).........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((......((((....))))....))))))....(((((........)))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....(((.......))).(((((((...)))))))....(((((........))))).)))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((......((((....))))....))))))...((((((........)))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((....((.......{{))......}}.....[[[[....((((((........))))))))))]]]].
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..((((....))))))))))))))))((((((((((..))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((......((((....))))....))))))....(((((........))))).)))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.......))).(((((((...))))))).....................)))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((.......))).((((((.....))))))...((((((...[[[[.))))))..]]]]...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((.((...((((....)))).)).))))))...((((((........)))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((......((((....))))....))))))...((((((((...)).)))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((.......))).............(((((...((((((........))))))...))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((......((((....))))....))))))...((((((........)))))).........
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((.((...((((....)))).)).))))))...((((((........)))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((...((((....)))).)).))))))....(((((........)))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(........)(((..)))((((..)..)))(((((((((((..)))).)))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((......((((....))))....))))))....(((((........))))).)))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((......((((....))))....))))))...((((((........)))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((......((((....))))....)))))......((((........)))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((......((((....))))....)))))......((((........)))).))))))....