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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00167



RNA: SPR_00167
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...)))......(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................((((.......))))((((..(((((.......))))))))).......
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(........).....(.........)........(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................(((((.....)))))((((..(((((.......))))))))).......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((......))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((................(((((.....)))))......(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((..(....))))))))))))(((((((((((((((.((((..)))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((....)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((....)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).(((((((...))))))).....((((((....).))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................(((((.......)))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((.(.(((......)))))))((.(((...(((((((((.((......)))))))))))))).))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((......))).(((.....))).........((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((......))).(((.....))).........((((.......)))).)))))))....