 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00177
RNA: SPR_00177
Rfam family:
tRNA
| GACUCGUUAGCUCAGCCGGUAGAGCAACUGGCUUUUAACCAGUGGGUCCGGGGUUCGAAUCCCCGACGAGUCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((((((((((......))))))..........)))))..((((.......)))))))))))).... |
| CMfinder(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.....(((((((......)))))))....(((....)))..(((((....))))).)))))))).... |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))))))))))).... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.(....).)))).(((((.......))))).....((((((....).)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.((())).)))).(((((.......))))).....(((((((())).)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((([[[[[[..))))..]]]]]]....(((....))).(((((.......)))))))))))).... |
| DAFS(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((.[[[....)))).(((((.......))))).]]]..(((((....))))).)))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.(.((((((((.....)))))..))).)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.[[[[[[.)))).]]]]]]................(((((.......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((..((((((((((..)))))))))))))))))))((((..(((((...)..))))(((..))))))) |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((........)))..(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((......(((((((......)))))))....(((....))).(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((......(((((((......)))))))....(((....))).(((((.......)))))))))))).... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))...))). |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((...(((((((......))))))).)))(((....))).(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.((.((((((((.....)))))..))).)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((([[[[[[[.)))).]]]]]]]....(((....))).((((((....).)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((......(((((((......)))))))...............(((((.......)))))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.(.((((((((.....)))))..))).)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.((.((((((((.....)))))..))).))))))..((((.......)))).))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.(.((((((((.....)))))..))).)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.((..))))))).....((((((...)..)))))))))))).... |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((....((...(((.....))).....))...))))..((((.......)))).))))))).... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.(.((((((((.....)))))..))).)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))).... |