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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00178



RNA: SPR_00178
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))(((((((....))).))))...)))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))(((((((....)))).)))...)))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....((((((.......))))))(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....(((((((.....)))))))(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..[[[[[)))..]]]]]((((..[[[[[))))...]]]]].....((((....[[[[[))))..]]]]]....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........))))....(((((((.....)))))))(((((.......))))).))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((([[[[[......)))]]]]](((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))(((((((..)))))..))))))))))))....
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....(((((((.....)))))))(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))...((((.((((....((((((.......))))))(((((.......)))))...))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))....).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).......................(((((.......))))).))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[[[[[..))))..]]]]]]........(((((((((....)))).))))).)))))))....