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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00183



RNA: SPR_00183
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((.........)))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((((.....)))))....)))............((((.........)))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......(((.......)))..))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((..........)))........................................)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......(((.......)))..))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))..((......))............(((.......)))..))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((......)))............................(((....))).....))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..[[[[)))....]]]]....................(((....))).....))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((.......)))..))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((....))).....))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(([[......))]]...........................((.......))...))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((..).)))))))..(((((((..)))))))((((..)))).))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((......)))......((......))............(((.......)))..))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................((((..)))).....))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))))))))))((((...........)))).......
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((....))).....))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((......)))....(((((....)))))..........(((.......)))..))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((........)))))))))).................((((.........))))...........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......))))).....................))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((....))).....))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((.......)))..))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((.......)))..))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((((((.((..)))))))((.(........)))..)))).((........))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........................................................))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........................(((....))).....))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..((((........)))).((((....)))).....)))).((((.........))))...........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..((((........)))).((((....)))).....)))).((((.........))))...........