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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00209



RNA: SPR_00209
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((((((((((.....))).....))).)))..))))..........(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((((((..........)))..)).))))..)))..........(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.........)))))((......))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((................(((((.........))))))(......))..(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((................)))).........((((.......)))).(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((......[[[[)))........]]]]............(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....((.....))...))))(((.((((((...((......))...)))))).)))......)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....((.....))...))))((..((((((...((......))...))))))..))......)))))))....
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((..)))))))..))))))))))((((..))))..((((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((((..(((..........))).....))))...((......))..(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..)))))).....(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(((((((((..........)))..)).)))))))((......))..(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((((((((..........)))..)).))))...............(((((.......))))))))))))....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((....((.....))...))))((..((((((...((......))...))))))..))......)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(((((((((.(......).)))..)).)))))))((......))..(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.........................)))...((......))..(((((.......))))))))))))....
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