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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00213
RNA: SPR_00213
Rfam family:
tRNA
| GCGGGGGUGGCUGAGCCAGGCCAAAAGCGGCGGACUUAAGAUCCGCUCCCGUAGGGGUUCGCGAGUUCGAAUCUCGUCCCCCGCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((.............)))((((((.......)))))).............(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))...((((((((.......))))...)))).((((((((......))))))))..))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......))))))......((((((((......))))))))..))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......)))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((......))))....(.((((((.......)))))).)...........(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((........))))......(((((.......))))).(((....)))...(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......))))))((.....))....(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.........(((......)))[[[[[[.....)))))))))).(((((((..]]]]]])))))))............. |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......))))))......((((((((......))))))))..))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((..(((......))))).))).))..)))))))))).((((...(((((.......))))).))))...... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))...(.(((((((....).)))))).)....((((((((......))))))))..))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......)))))).......((((((([[....)))))))]].))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((......)))).......(((((.......))))).(((....)))...(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......))))).....((((((.......))))))......((((((((......))))))))..))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((...........)))).(((((.(...).)))))..............(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))...((((((((.......))))).((....))((((((......)))))).)))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((({{{...))))).....((((((}}}....))))))(((....)))((([[[[[...))).]]]]]))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((........))))..(((((............)))))......((((((((......))))))))..))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))......((((...............)))).((((((((......))))))))..))))))).... |
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| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((......))))....((((((((.......)))))...))).((((((((......))))))))..))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))...(((((((((....).)))))...))).((((((((......))))))))..))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((......)))))......((((((....).))))).......((((((((......))))))))..))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((......))))....((((.(((.......))).((((....)))).))))(((.......)))..))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((......)))).......(((((.......))))).((.....))....(((((.......)))))))))))).... |