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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00215
RNA: SPR_00215
Rfam family:
tRNA
| GCCUUUUUGGCGGAAUUGGCAGACGCAUUAGACUCAAAAUCUAACGAAGAAAUUCGUAUCGGUUCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).............(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((((((((.........((((.......))))(((((....))))).)))))).....)))..))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((..(((((((.........((((.......))))(((((....))))).)))))))....))))..)))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....................(((((.......)))))((((....))))((((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................(((((.......)))))((((....)))).(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......)))))((((....)))).(((((.......)))))))))))).... |
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| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))..((((.......))))(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((......[[[.....)))...]]].(((((.......)))))(((.........[[[[[[.)))...]]]]]].......... |
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| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((((.(((((.((.....((((.......))))(((((....))))).)).).)))).))))..))))))).... |
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| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((...........)))..((((.......)))).((((....)))).(((((.......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).................(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).............(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......)))))((((....)))).(((((.......)))))))))))).... |
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| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.....)))................(((((.......)))))............((((((.......)))))).......... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((((.((((..............))))((((..(((((....)))))...))))....))))..))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((..........))).......(((.......))).(((((....))))).((((.......))))..)))))).... |
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