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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00219



RNA: SPR_00219
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))...............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.........(((.(.(((((((...)))))))..).)))..))))).(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))..(((((((...((((..(((((....)))))...))))..)))))))..)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((((.....))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((((...)))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))..((((.......))))..((((....))))..(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...((....))))).(((((((...)))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((((...)))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((((.(((......(((((((...)))))))(((((....)))))))).))))).....))).)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((((...)))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))..(((((((..((((((.(((((....))))).).))))).)))))))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).((((((.....))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..)).)))))))((((((...))))))(((((((..)))))))((((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((...........))).(((((((...)))))))(((((....))))).(((((.......))))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((((...)))))))((((((..)))))).(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))...............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).((((((.....))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((((.(((......((((((.....))))))(((((....)))))))).))))).....))).)))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((((...)))))))(((((....))))).((((((....).))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..(((...........)))..(((((((.......((((..............))))...)))))))..)))))).....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....................(((((((..(((((..(((((....)))))...))))).)))))))..)))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((......................(((((.....))))).(((((....))))).(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((.....))).........((((((.....)))))).((((....))))..(((((.......))))).))))))....