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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00220
RNA: SPR_00220
Rfam family:
tRNA
| GCGAAGGUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGCUUCAGGUGUUAGUGUCCUUACGGACGUGGGGGUUCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((.((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......))))))).)))).... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.((((.(((((.............))))).)))).(((((.((.((((....))))..(((((.......)))))..)).)))))) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.((((.(((((.............))))).))))..((((.(((((((....))))).(((((.......)))))..)).))))). |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((..((((.............))))..)))).(((((...(((((....))))).(((((..........)))))..))))). |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((.(((((((....))))).(((((.......)))))..)).))))). |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.((.................((((((((.......))))))))((....))....(((((.......))))))).)))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.((..(((...........)))((((((.......))))))((((....))))..(((((.......))))))).)))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((.(((((((....))))).(((((.......)))))..)).))))). |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....((((...............((((((((.......))))))))......((((..[[[[[.....)))).]]]]]...)))). |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.........[[[[))))).)))).........]]]].....(((.[[[[[[[))).........]]]]]]].... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((.((.((((....))))..(((((........))))).)).))))). |
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| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((....((((....))))..(((((.......))))).....))))). |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((((((((((((..))))).))))))))))(((((((((.((((....))))((((((((...)..)))))))))))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((.((.((((....))))..(((((........))))).)).))))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((..((((((....))))))(((((.......))))).....))))). |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))...............(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.((..(((...........)))((((((.......))))))((((....))))..(((((........))))))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((.(((((.............))))).)))).(((((.((.((((....)))).....................)).))))). |
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