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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00221
RNA: SPR_00221
Rfam family:
tRNA
| GCCGAGGUGGUGGAAUUGGUAGACACGCUACCUUGAGGUGGUAGUGCCCAAUAGGGCUUACGGGUUCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((..(((((.((((((..((((((....)))))).))((((....)))))))).))))).....))).))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((...(((((....(((((((((....)))))).))).)))))...))).(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(....(((((....(((((((((....)))))).))).)))))....)..(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((...(((((..(.((((((((((()))))))).)))))))))...))).(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((((((((.............))))))))))...(((((..((((....))))..(((((.......)))))......))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((((.............)))))))))((((.[[[[..((((....))))..(((((.......)))))))))..]]]]. |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((..(((((.(((.....((((((.......))))))((((....)))).))).))))).....))).))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.((....(((((.....))))).((((.(.((((.((((....)))))))).).))))..))))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((..(((((.(((......(((((.......))))).((((....)))).))).))))).....))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(((((......(((((((.......))))))).))))).......(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.......(((((.....))))).((((.(.((((.((((....)))))))).).))))....))).))))))).... |
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| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((([[[[[[[...))))).....]]]]]]].(((((.......((((....))))...((((.......)))).)))))...... |