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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00225
RNA: SPR_00225
Rfam family:
tRNA
| GCGGAACUGGCGGAAUUGGUAGACGCGCUAGAUUCAGGUUCUAGUGGUUUCACGACUGUCCGGGUUCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......(((((((((((((.((.((((((((.......)))))).)).))...)))).(((((.......)))))))))))..))) |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((...(((..(((.(((((((.......)))))))))))))...))))(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((....(..((((.(((((((.......)))))))))))..)..))))(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..............(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..))))))))((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..................(((((((.......))))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..))))))))((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))))))(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))))))(((((.......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((........(((.(((((((.......))))))))))......)))))((((.......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..(((((((((.(((((((((...)))))))))))))))))))))))(((((...)..)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))))))(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((............(((((((.......))))))).........)))))((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))...............(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
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| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........(((((((((..((((.(((((((.......)))))))))))..)))....(((((.......))))).)))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.......((((.(((((((.......))))))))))).....))))).((((....))))..)))))))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(..)..((((((((.......((.(((((((.......)))))))))..(......).(((((.((..))))))).)))))..))) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((..(((..((((.(((((((.......)))))))))))..))))))).((((.......)))).))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.............))).(((.......)))...((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((([[[..........))).(((]]]....)))...((((....))))..(((((.......)))))))))))).... |