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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00226



RNA: SPR_00226
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((.((((...((((((((((.......)))))..(((...))))))))....)))).))))).)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....(((((..(((((((.......)))))))...)))))))))(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.....(((((((.(((((((.......))))))).).)))))))))(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.......))))))(((.....)))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))((((...))))..(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.....(((((((.(((((((.......))))))).).)))))))))(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((..(((((((.......)))))))...))))))...(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.....[[[[[[)))((((((.......))))))....]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......))))).((((...))))..(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....((((((.(((((((.......))))))).).)))))))))(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((.....((((((..(((((((.......)))))))...)))))))).(((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((.((((((((.......))))))..))))))))...(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((..(((((((.......)))))))...))))))...(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))..............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....(((((.((((((((.......))))))..)))))))))))(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((..(((((((.......)))))))...))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((((((.(((((((.......))))))).).))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.....(((((((.(((((((.......))))))).).)))))))))(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((..(.((((((..(((((((.......)))))))...))))))(((......))))..)))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((((((.(((((((.......))))))).).))))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((.((((((((.......))))))..))))))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((...........))))).(((.......))).(((((....((((....))))......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((([[[.[[..)))))).....]]]]]...........(((((((.....)))..(((((.......))))).....))))..