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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00227



RNA: SPR_00227
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((..........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........))))...(((((((..(((((((((((....))))).)))))).)))).))).)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((...((((((((((....))))).)))))..)))).)))..))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..(((((((((((....))))).)))))).))))).))..))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))).((((((.......))))))(((....)))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((...(((((.........)))))((((((.......))))))............(((((.......)))))....)))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..(((((((((((....))))).)))))).))))).))..))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((...(((((((.......))))))))))).......(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...........(((((...((((((.......))))))))))).(((...[[[[[)))....]]]]].))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..((((((.((((....))))..)))))).)))).)))..))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..((((((..(((....)))...)))))).)))).)))..))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))(((((([[[..[[))))))(((....)))..(((((]].]]].))))).))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..(((...)))(((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..((((((.((((....))))..)))))).))))).))..))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((...(((((((.......))))))))))).......(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.............((((.(((((((.......)))))))((((.....)))).))))...........))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..))(((((((..(((((.(((..((((.......))))))))))))....((((((((...)..))))..))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..((.((((...((((...(((....)))....))))..))))..))..))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........)))))..(((((((..((((((..(((....)))...)))))).))))).))..))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.........))))).(((((.......))))).(((....)))..(((((.......))))).))))))....
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