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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00228



RNA: SPR_00228
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((......((((...))))............)))))..............(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))..((((((...((((.(((.............)))))))..))))))...)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))(((((.......))))).((.........))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...........))))(((((.......)))))..............).(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))((((([[[[[..)))))....]]]]].......(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...........)))))(((.[[[[[......)))..]]]]].......(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...........))))).((((((..(((((.(((.............)))))))).))))))...)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))((((((..)))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((...........)))).((((.......)))).................(((((.......))))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((([({((<<<<.<<)}])(((((.))....)))))..((((..(((.>>)>aaaaa)))))))AAAAA)))))))>>>)
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))................(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))(((((.......))))).((.........))..(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))((((([[[....))))).((.(......)))..(((((...]]].))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...........))))).((((((..(((((....................))))).))))))...)))))))....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))..((((((..(((((.(((.............)))))))).))))))...)))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))..((((((..(((((.(((.............)))))))).))))))...)))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(((((......)))).(((((.......))))).(((((((((((((..))))))))))))))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...........))))..(((((...................................)))))...)))))))....
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