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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00229



RNA: SPR_00229
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))..........(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...(((((......((((((.......)))))))))))..))))((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...(((((......((((((.......)))))))))))..)))(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((........((...((((((((....).)))))))))....)))(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(.........(...(((((((.......)))))))).....)..(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.................(((((((.......)))))))..........((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...........(((...(((((((....[[[))))))))))((((......))))...]]]..))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(.....).((((((((....).))))))).........(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...((............((((((((....).)))))))...((((......))))...))...))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((..)).))))))(((((((..))).))))((((..)))).((((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................((((((((....).))))))).........(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))...........(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))...........(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((.......)))))(((....))).(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...........((.....((((((((....)).)))))).....))..(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................((((((((....).)))))))...(((...[[[[[)))....]]]]])))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......))))))).........(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...((............((((((((....).)))))))...((((......))))...))...))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...(((((......(((((((....)).))))))))))..)))).(((.......))).))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((...(((((......(((((((....)).))))))))))..))))((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(...........)(((((((.(....)))))))).........((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................((((((((....).)))))))..........((((.......)))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................((((((((....).))))))).........(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........(((((.....)))))...........((((....)))).((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.............)))(((((....)).))).(((....)))..((((.......)))).)))))))....