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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00236



RNA: SPR_00236
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........)))(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((..((.((((..........(((.(((.(.((((......)))).).))).))))))).))))..)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((......(((((...(((((.........)))))..)))))..((((((((.......)))))..))).)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((.(....)..)))).............(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.........)))))((......))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((...........))).............((((......))))....(((((.......))))).))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((((..))).)))))(((....)))..(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((.....((((.......)))).......((((......))))...((((((.......)))))).....)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.((((.......(((((.........))))).(((((.....)))))..)))).)))...)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.(((...(((...(((((...(((........)))...)))))....)))))).)))...)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.((((.......(((((((....)).))))).(((((.....)))))..)))).)))...)))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.(((.........((((.........))).............).......))).)))...)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).(((((....................)))))(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........))).((((((....)).))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(..(((.((((........(((((...(((........)))...)))))......)))).)))..))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((..(((...........................((((....))))((((((.......)))))))))..)))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((......(((((...(((((.........)))))..)))))....((((((.......)))))).....)))))
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((..((((((((.(.((((((((..))).)))))).)))))).....((((.((..)))))).))..).)))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((.((((.......(((((((....)).)))))..................)))).)))...)))))))....
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((....))))....(((.......((((((....)).)))).(((....))).((((((.......))))))......))).