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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00246
RNA: SPR_00246
Rfam family:
tRNA
| ACUUUUAAAGGAUAGUAGUUUAUCCGUUGGUCUUAGGAACCAAAAAAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....((((.......)))).))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((......(.(((((....))))).)....)))).))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....))))))...((........(((((....)))))......))...))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((......))))).((((((....).)))))....((((.......)))).))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((....(((((......))))).(((((.......)))))....((((.......))))...))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((((....)))))).(((((.......))))).....((((((..............)))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((((....).)))))....((((.......)))).))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).(((((.......))))).....(((.......)))..))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((..))))))))((((((((..((((((((..)))))))))))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((((....).)))))....((((.......)))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).(((((.......)))))....((((.......)))).))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....((((.......)))).))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((((....)))))).(((((.......))))).....((((((..............)))))) |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((((....).)))))....((((.......)))).))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((...(((((......))))).(((((.......))))))))).((((((..............)))))) |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((...(.((((((...........)))))((((((..))))))))....))...))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((........(((((....)))))......)))).))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).(((((.......)))))....((((.......)))).))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((....)))))).((((((....)).))))....((((.......)))).))))))).... |