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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00263
RNA: SPR_00263
Rfam family:
tRNA
| GGAGAGAUGGCCGAGCGGUCUAAGGCGCUGGUUUAAGGCACCAGUCCCUUCGGGGGCGUGGGUUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......((.((((.((((((.......)))))).)))).)).)))(((((.......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((((.......))).))))..)))....(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..............((((.((((((.......)))))).)))).......(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))........((((.......))))(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))(((....)))..(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((........((((.((((((.......)))))).)))))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))........((((.......))))(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))...((.(((.......))).)).(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......(([[[[.....))]]]](((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))...((.(((.......))).)).(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((((..)))))........((((.......))))((((((..))))))(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((...........)).(((.......))).)))(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......(((.......)))....(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.........((((..(((((.......)))))..))))....)))(((((.......)))))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....)))).((((.((((((.......)))))).)))).((((.............))))..))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))...((.(((.......))).)).(((((....)))))(((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.......)))))((((((.......))))))((((..))))..((((((...)..)))))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.((((....)))).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((.((((.(..(....)..).)))).((((((((....))))).))))))))....))).))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))....((((.(((.......)))...(((....)))))))(((.......)))..))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....(((((([[[[....))).(((...]]]]))).(((((....))))).{{{{.)))...}}}}.))))))).... |