 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00281
RNA: SPR_00281
Rfam family:
-
| AAUAAGAUAGGAUAAGUUGAGUCUGUGAGGUUCAUACCCUCUUGGUGUUUUUCUCUUAUUGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((.......))))(.((((.......)))).)...(.....)))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((.(((((((((((...))))))).(((.....))))))).))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((....(((..(((((...)))))..)))....)))))...))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...............(((.((((.......)))).)))........))))))..... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..........................((((.......))))....................... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......))))..((((.......))))............))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............(((.((((.......)))).)))........))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....(((((((..............((((.......)))).[[[[.......)))))))]]]] |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((................(((.((((.......)))).))).........)))))..... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))).))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...........((((((...))))))(((((.....))))).....))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......(((((..........)))))((((.......)))).((((..............)))) |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..........................((((.......))))....................... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((............((((.......))))....))))))..))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..((((.....))))..)))....))))))..))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((....((((..)..)))..(((......))).(..).(..)..))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((....(((..(((((...)))))..)))....))))))..))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(..(((....(((..((((.....))))..)))....)))..)..))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((.......))))..((((.......))))..(((..............))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((....[[[))))..((((.]]]...)))).((((..............)))) |