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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00289



RNA: SPR_00289
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........))))(.((.(.......).)).)....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))))))....(((((......)))))..((((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))))))).((.((((........))))))((((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((...))))))).......................(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))..((.(.......).))......(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((...))))))((.((.((.....)).))..))..(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((...)))))))...(.(((..........))).)(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))....(((((......)))))..((((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((...)))))))....(((((......)))))...(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))))))).((.(((((......))))))).(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))....(((((......)))))..((((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))......................((((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))))))((((((((...))))))))...(((((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))))))).((.(((((......))))))).(((((.......))))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))))))......................((((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.....)))))).((.((((........)))))).(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .................((((........(((((.........)))))((((((.......))))))..))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((...)))))))..................(((((.........)))))...)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))....(((((......)))))..((((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....)))))).((.(((((......)))))))((((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.....))))))...(.(((........))).)...(((((...)..)))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))))))).....(((........)))....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))))))......................((((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))....((((........))))...(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((.....))))))....((((........))))...(((((.......))))).))))))....