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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00298



RNA: SPR_00298
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.(((.((.((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......)))))...))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..........))))...(((.(.(((((.......))))).).)))..)))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....))))).......(((..((((.......))))(((...(((((.......)))))...))).))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((....((((.......)))).....))).........(((...(((((.......)))))...))).....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).......................(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))......(((.....).)).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.((((.......)))).)).)))).........(((...(((((.......)))))...))).....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[[[[..))))..((((]]]]]..))))..(((.{{{{{)))....}}}}})))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((..[[[..)))).............]]]...(((.[[[[[)))....]]]]].....))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....))))).(((...(((.....))).....))).(((...(((((.......)))))...))).....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(([[[..((((.......))))......)).........(((...(((((.......)))))]]]))).....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..(.((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......)))))...).))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....)))))...((..[[[..((((.......))))[[[...[[[[[.))....]]]]]...]]].]]].
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((........(((...(((.....))).....))).......(((((.......))))).....))))).
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))...(((.......))).......(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......)))))...........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.((.((..(((...(((.....))).....)))..))...(((((.......)))))...))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......))))).....))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..(((([[[[[..))))..((((]]]]]..))))......(((((.......))))).....))))).