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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00317



RNA: SPR_00317
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((.........)))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((((((.....)))......))))))))......(((((.......))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((.........)))).(.((.........)))......(((((.......))))))))))).....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((....(((...)))....))))))))......(((((.......))))))))))))....
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((((...(.....).))..))))))))......(((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))....((((........))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((((..(((...)))))..))))))))......(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((((((.....))).[[[[.))))))))]]]]..(((((.......))))))))))))....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((....(((...)))....)))))))).......((((.......)))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((.(..(((...)))..).))))))))......(((((.......))))))))))))....
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Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((..((((......))))))..(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((((((.(..(((...)))..).)))))))).......((((.......)))).)))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))....(((((......)))))....((((.......)))).)))))))....
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