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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00320
RNA: SPR_00320
Rfam family:
tRNA
| CAGAUAGAAGCCAAAAGGUCAGGCGCUUUCUUUGGGAGAAAGACCUAGUUAGUUCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(.(((.......))).)))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((.((.(((((......((((((...)))))))))))..)).)))..........))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((((((..((..(((.......)))))..)))....))))...))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..................((((((.....)))))).......(((.......)))..))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.........))).((((((.....)))))).....(.(((.......))).)))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.........))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((....))..(((..(((((((...))))))).))).(.(((.......))).)))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((((........[[[[[[[..((((((.{{{{)))))).}}}}...........))))))...]]]]]]]. |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...[[[[[.))).(((((...)))))...]]]]]..................))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).))).........((.....))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((.(((((.....[[[[[[[.)))))...{{{{{....((.((....)).))..)))).}}}}}]]]]]]]. |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..................(((((.......)))))........((.......))...))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))).((((((((((((...))))))((((((..)))))))))))).))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).))).....(.......)....))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.........))).(((((((...)))))))......................))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.........))).((((((.....))))))((.......))..((.....))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........(((....[[[[[)))........(((((...((((.............)))).)))))..]]]]]. |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).)))...(((.......)))..))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.............))))(((((.....)))))..(((...........)))..))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ................(((((((.........(((((...((((.............)))).)))))))))))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).)))..................))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).)))..................))))))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..............(((.(((((((...))))))(..(((..)))..).))))....))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((....)).......(((((((...)))))))......................))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....))).(((..(((((((...))))))).)))..................))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((.............))).(((.....))).((((.............))))...))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((.............))).(((.....))).((((.............))))...))))))).... |