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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00329



RNA: SPR_00329
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((...........)))(((((((((...)))))))))...((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...((((.....((((((((.....)))))))).....))))...))))).))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(.((((.....((((((((.....)))))))).....)))))..))))).))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.................(((((((.......)))))))...((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(.((((.....(((((((((...))))))))).....)))))..))))).))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((....))).....(((((((.[[[[[[))))))).]]]]]]...........))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((.....(((.....((((((((.....)))))))).....)))......))).))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...(((((.....(((((((((...))))))))).....)).)))...))).))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...(((((.....((((((((.....)))))))).....)).)))...))).))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((...((((......(((((((.....)))))))....[[))))...))))]]))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((..((((((...))))))))))))))))))((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...(((((.....(((((((((...))))))))).....))).))...))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))(((((((((...)))))))))..(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((........))).....((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...(((((.....((((((((.....)))))))).....))).))...))).))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((......)).)))(((((((....))).))))...((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((...(((((.....((((((((.....)))))))).....))).))...))).))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..((...(((((.....((((((((.....)))))))).....)).)))...))..))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))....