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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00339



RNA: SPR_00339
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))))..(((..((((((((((....)))))))))).)))..))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))))..(((..((((((((((....)))))))))).)))..))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))))(((((.......))))).....((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........))))).((((..((((((((((....)))))))))).))).)))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........))))).......((((((((((....))))))))))......))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))))..(((..((((((((((....)))))))))).)))..))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))...(((..((((((((((....)))))))))).)))..))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........))))).(((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))))))))..))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......((((.....))))((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((........)))))((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......((((.....))))((((...((((((((((....))))))))))...)))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))........((((((((((....))))))))))......))))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......(((.......))).))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((...[[[[.)))).(((((...{{{{))))).}}}}.(((]]]]...)))..)))))))....