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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00356



RNA: SPR_00356
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((..[[[[..)))).(((((..]]]].)))))...((((((.......))))))))))))....
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((..........))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..))))))))))((((((..))))))....(((((((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....................(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.(....))))))...((((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................(((((.......)))))...((((((.......))))))..........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((((......(((((.......)))))........)))))........)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..)))))))))..(((((..))))).......(((((...)..)))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....................(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))).))))))....